Der 16S Microbiome NGS Assay ist ein Next Generation Sequencing (NGS) Test Kit zur spezifischen Amplifikation der hypervariablen Regionen V3/V4 des 16S rRNA Gens von Bakterien in Stuhlproben. Jedes Kit enthält einen eigenen Code, der das Hochladen der Sequenzierdaten in der von ViennaLab spezifisch erstellten Datenbank «Microbiome Analysis Webtool» ermöglicht. Die Resultate werden in einem aussagekräftigen Bericht rapportiert.
Die 16S ribosomale RNA besteht aus hochkonservierten und auch aus hypervariablen Regionen, sie ist gut für die Untersuchung der bakteriellen Phylogenie und Taxonomie dokumentiert. Das 16S rRNA-Gen ist ein genetischer Marker, der zur Identifizierung und Klassifizierung von Bakterien verwendet werden kann. Dabei werden die konservierten Regionen als universelle Primer-Bindungsstellen verwendet und die hypervariablen Regionen für artspezifische Primer, um zwischen verschiedenen Bakterien unterscheiden zu können. Mit den Sequenzierungsdaten des 16S rRNA-Gens können Bakterien in komplexen biologischen Probenmaterial identifiziert werden, z.Bsp. in klinischen Proben, Stuhlproben oder Umweltproben.
Als Mikrobiom wird die Gesamtheit der Mikroorganismen (Bakterien, Pilze, Archaen, Viren) bezeichnet, die ein mehrzelliges Lebewesen besiedeln. Diese Mikroorganismen leben im Darmtrakt, auf der Hautoberfläche und in der Schleimhaut, ihre Zusammensetzung ist für jede Person einzigartig. Veränderungen im Mikrobiom des Darms können zu metabolischen Störungen führen und sind mit Krankheiten wie Typ II Diabetes, Fettleibigkeit, Krebserkrankungen, Fettleber, neurologische oder andere Krankheiten assoziiert.
Eckdaten:
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*Bemerkung: Die Kits unterscheiden sich in den Indexing Primer Sets. Wenn Sie mehr als 96 Proben auf einer Flow Cell analysieren wollen, bestellen Sie bitte Kits mit unterschiedlichen Sets (z.B. SetA/ und Set B). Sellen Sie sicher, dass alle Libraries desselben Pools dieselbe Indexing Primer Kombination haben.
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